Windows2000-tartományban a tartomány-üzemmód, amelyben valamennyi tartományvezérlő futnak Windows2000 és a tartományi rendszergazda váltott vegyes üzemmódról átkapcsolt natív üzemmódra. Natív módban támogatja az univerzális csoportokat és a csoportok beágyazását. Natív módban, WindowsNT4.0 rendszerű tartományvezérlők vagy korábban nem támogatottak. Windows Server2003 tartományok natív módban a továbbiakban "Windows2000 natív", és ez a tartomány három funkcionális szintjének elérhető egyike.