En los dominios de Windows 2000, el modo de dominio en qué dominio todos los controladores de un dominio apuntan a Windows 2000 y un administrador de dominio ha cambiado el modo de operación de dominio de modo mixto a modo nativo. Modo nativo apoya grupos universales y anidamiento de grupos. En modo nativo, controladores de dominio que ejecutan WindowsNT4.0 o anteriores no son compatibles. En dominios Windows Server2003, modo nativo se denomina 'Windows2000 nativa', y es uno de los tres niveles funcionales de dominio disponibles.